1947年印巴分治方案确定后，在旁遮普爆发了大规模的教派暴力冲突。对于东、西旁遮普来说，一方的教派暴力冲突往往引发另一方的暴力仇杀。从东旁遮普进入巴基斯坦的穆斯林难民给西旁遮普的穆斯林带来锡克教和印度教控制下的东旁遮普抢劫、强奸、屠杀穆斯林的恐怖消息。西旁遮普穆斯林看到从印度东旁遮普迁来的一个个穷困潦倒、伤痕累累的穆斯林同胞，立即激起报复印度教徒和锡克教徒的怒火。
与此同时，逃往巴基斯坦的穆斯林难民为了获得西旁遮普非穆斯林的财产，也故意制造混乱和恐慌，迫使印度教徒和锡克教徒逃往东旁遮普。8月末，西旁遮普到处是袭击锡克教徒和印度教徒的教派骚乱，穆斯林武装暴徒肆意洗劫印度教和锡克教村庄，截杀逃亡印度途中的难民，强奸异教徒妇女。即使真纳和穆斯林其他领导人劝说穆斯林停止报复，对印度教和锡克教徒的仇杀仍然没有减少。大批的锡克教徒和印度教徒被迫跨过东旁遮普边界逃往印度。
伴随着难民的逃离，更大规模的袭击、屠杀异教徒难民的暴力冲突在东、西旁遮普边境发生。9月初，一列负责运送4500名穆斯林难民的火车在驶往拉合尔途中遭到锡克教武装的袭击，车上3000多名穆斯林被残忍地杀害clash订阅码。。发生在旁遮普的教派暴力冲突随着媒体的传播，震惊了两国社会各界和世界爱好和平的人民，面对来自国内和国际社会的强大舆论压力，新组建的东、西旁遮普政府不得不搁置其他政务，全力以赴地处理教派暴力冲突。9月3日，印、巴两国首脑发布联合声明，命令所有教派群体停止暴力袭击，并警告一经发现，施暴者将被立即处决。
此外，两国政府分别在东、西旁遮普设立联合军事撤离组织，动用一切交通工具从对方境内抢运难民以及遣送对方难民出境，安置上百万的流入难民。10月中旬clash订阅码，东clashootingbrake带顶箱、西旁遮普教派暴力冲突渐渐平息，社会秩序才慢慢恢复。
